Gli effetti collaterali del vaccino Cervarix che si presentano più frequentemente a livello locale sono: dolore 93,4%, rossore 35,6%, gonfiore 34,3%. A livello sistemico le reazioni più frequenti sono state cefalee 62%, fatica 58%, disturbi gastrointestinali 33,5%, prurito 24,5% e sempre il 16,6%. Gli effetti collaterali del bacino Gardasil che si presentano più frequentemente livello locale sono: dolore 83,9%, gonfiore 25,4% e rossore 24,6%.
A livello sistemico le reazioni frequenti sono state sempre 13%, nausea 7%, naso faringite 6%, vertigini 4% e diarrea 4% (UFSP, Recommandations des vaccinations contre les papillomavirus humains (HPV), février 2008).