A volte possibile che le cellule poste in coltura non crescono adeguatamente, con conseguente necessità di ripetizione del prelievo al fine di allestire nuove colture cellulari.
Questo problema è ben conosciuto, sebbene non sia molto frequente; avviene infatti una volta su 1000 in caso di cariotipo da liquido amniotico e una volta su 200 in caso di cariotipo da villi coriali